MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011988	GCC	2	6	290986	290991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106364
5502	NC_011988	CGC	2	6	291006	291011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106364
5503	NC_011988	AAG	2	6	291041	291046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106364
5504	NC_011988	TGGAC	2	10	291093	291102	20 %	20 %	40 %	20 %	222106364
5505	NC_011988	AAT	2	6	291131	291136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106364
5506	NC_011988	CGG	2	6	291156	291161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106364
5507	NC_011988	GCG	2	6	291194	291199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106364
5508	NC_011988	CGG	3	9	291229	291237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106364
5509	NC_011988	TCC	2	6	291254	291259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106364
5510	NC_011988	AAGCC	2	10	291281	291290	40 %	0 %	20 %	40 %	222106364
5511	NC_011988	TGG	2	6	291339	291344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106364
5512	NC_011988	GTCC	2	8	291361	291368	0 %	25 %	25 %	50 %	222106364
5513	NC_011988	GCC	2	6	291377	291382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106364
5514	NC_011988	CCG	2	6	291396	291401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106364
5515	NC_011988	TTC	2	6	291419	291424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106364
5516	NC_011988	G	6	6	291437	291442	0 %	0 %	100 %	0 %	222106364
5517	NC_011988	GCT	2	6	291562	291567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106364
5518	NC_011988	TCA	2	6	291580	291585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106364
5519	NC_011988	TGA	2	6	291613	291618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106364
5520	NC_011988	CGGT	2	8	291765	291772	0 %	25 %	50 %	25 %	222106364
5521	NC_011988	CTTCGA	2	12	291897	291908	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222106364
5522	NC_011988	ACG	2	6	292005	292010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106364
5523	NC_011988	ACCG	2	8	292045	292052	25 %	0 %	25 %	50 %	222106364
5524	NC_011988	TGT	2	6	292062	292067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106364
5525	NC_011988	TGAAAC	2	12	292136	292147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222106364
5526	NC_011988	ACAAA	2	10	292158	292167	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5527	NC_011988	ACG	2	6	292172	292177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_011988	CAGC	2	8	292261	292268	25 %	0 %	25 %	50 %	222106365
5529	NC_011988	GC	3	6	292287	292292	0 %	0 %	50 %	50 %	222106365
5530	NC_011988	GCA	2	6	292492	292497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106365
5531	NC_011988	GCG	3	9	292506	292514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106365
5532	NC_011988	AGC	2	6	292593	292598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106365
5533	NC_011988	CGT	2	6	292651	292656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106365
5534	NC_011988	GCC	2	6	292887	292892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106365
5535	NC_011988	GAA	2	6	292932	292937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106365
5536	NC_011988	GCC	2	6	292938	292943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106365
5537	NC_011988	GCA	2	6	292977	292982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106365
5538	NC_011988	GCC	2	6	293007	293012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106365
5539	NC_011988	GCC	2	6	293205	293210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106365
5540	NC_011988	AC	3	6	293236	293241	50 %	0 %	0 %	50 %	222106365
5541	NC_011988	AACG	2	8	293397	293404	50 %	0 %	25 %	25 %	222106365
5542	NC_011988	AGC	2	6	293536	293541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106365
5543	NC_011988	CGC	2	6	293564	293569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106365
5544	NC_011988	GCT	2	6	293621	293626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106365
5545	NC_011988	GCTG	2	8	293641	293648	0 %	25 %	50 %	25 %	222106365
5546	NC_011988	CATCGA	2	12	293653	293664	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222106365
5547	NC_011988	GCT	2	6	293699	293704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106365
5548	NC_011988	ACG	2	6	293710	293715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106365
5549	NC_011988	GCT	2	6	293741	293746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_011988	GCT	2	6	293811	293816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106366
5551	NC_011988	CGA	2	6	293828	293833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106366
5552	NC_011988	TGTC	2	8	293837	293844	0 %	50 %	25 %	25 %	222106366
5553	NC_011988	GAT	2	6	293898	293903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106366
5554	NC_011988	GCA	2	6	293979	293984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106366
5555	NC_011988	TGC	2	6	294062	294067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106366
5556	NC_011988	GGC	2	6	294150	294155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106366
5557	NC_011988	CAT	2	6	294306	294311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106366
5558	NC_011988	TGG	2	6	294350	294355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106366
5559	NC_011988	CG	5	10	294415	294424	0 %	0 %	50 %	50 %	222106366
5560	NC_011988	CGG	2	6	294519	294524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106366
5561	NC_011988	ATC	2	6	294532	294537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106366
5562	NC_011988	CGGC	2	8	294564	294571	0 %	0 %	50 %	50 %	222106366
5563	NC_011988	GAT	2	6	294606	294611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106366
5564	NC_011988	TTG	2	6	294623	294628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106366
5565	NC_011988	GCA	2	6	294727	294732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106367
5566	NC_011988	TC	4	8	294736	294743	0 %	50 %	0 %	50 %	222106367
5567	NC_011988	TGC	2	6	294793	294798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106367
5568	NC_011988	CTG	2	6	294804	294809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106367
5569	NC_011988	GGC	2	6	294863	294868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106367
5570	NC_011988	CGA	2	6	294896	294901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106367
5571	NC_011988	TGC	2	6	294928	294933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106367
5572	NC_011988	CGG	2	6	294935	294940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106367
5573	NC_011988	CGT	2	6	294971	294976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106367
5574	NC_011988	CGG	2	6	294992	294997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106367
5575	NC_011988	CTG	2	6	295044	295049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106367
5576	NC_011988	GCC	2	6	295230	295235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106367
5577	NC_011988	CCG	3	9	295345	295353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106367
5578	NC_011988	GCC	2	6	295382	295387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106367
5579	NC_011988	CCG	2	6	295535	295540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106367
5580	NC_011988	CCA	2	6	295599	295604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106368
5581	NC_011988	CGC	2	6	295618	295623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106368
5582	NC_011988	TTG	2	6	295671	295676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106368
5583	NC_011988	TCT	2	6	295723	295728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106368
5584	NC_011988	GCG	2	6	295815	295820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106368
5585	NC_011988	CGT	2	6	295925	295930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106368
5586	NC_011988	CGG	2	6	296020	296025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106368
5587	NC_011988	TGA	2	6	296040	296045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106368
5588	NC_011988	TGC	3	9	296047	296055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106368
5589	NC_011988	TTG	2	6	296142	296147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106368
5590	NC_011988	CGG	2	6	296214	296219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106368
5591	NC_011988	GCG	2	6	296238	296243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106368
5592	NC_011988	TCTG	2	8	296278	296285	0 %	50 %	25 %	25 %	222106368
5593	NC_011988	CGC	2	6	296286	296291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106368
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5596	NC_011988	TC	3	6	296470	296475	0 %	50 %	0 %	50 %	222106369
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5600	NC_011988	GGGGA	2	10	296713	296722	20 %	0 %	80 %	0 %	222106369
5601	NC_011988	GAAA	2	8	296748	296755	75 %	0 %	25 %	0 %	222106369
5602	NC_011988	TCT	2	6	296775	296780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106369
5603	NC_011988	CGG	2	6	296835	296840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106369
5604	NC_011988	GGT	2	6	296889	296894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106369
5605	NC_011988	TC	3	6	296982	296987	0 %	50 %	0 %	50 %	222106369
5606	NC_011988	CAT	2	6	297052	297057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106369
5607	NC_011988	TTG	2	6	297092	297097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106369
5608	NC_011988	CTG	2	6	297127	297132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106369
5609	NC_011988	GCC	3	9	297152	297160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106369
5610	NC_011988	GCG	2	6	297164	297169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106369
5611	NC_011988	CCCA	2	8	297193	297200	25 %	0 %	0 %	75 %	222106369
5612	NC_011988	GAT	3	9	297205	297213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106369
5613	NC_011988	GCG	2	6	297283	297288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_011988	CAA	2	6	297335	297340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_011988	GCT	2	6	297395	297400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106370
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5617	NC_011988	TC	3	6	297567	297572	0 %	50 %	0 %	50 %	222106370
5618	NC_011988	GCA	2	6	297586	297591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106370
5619	NC_011988	GCC	2	6	297627	297632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106370
5620	NC_011988	TGCG	2	8	297637	297644	0 %	25 %	50 %	25 %	222106370
5621	NC_011988	GAT	2	6	297665	297670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106370
5622	NC_011988	TGA	2	6	297703	297708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106370
5623	NC_011988	GCA	2	6	297758	297763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106370
5624	NC_011988	GCA	2	6	297827	297832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106370
5625	NC_011988	CGG	2	6	297854	297859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106370
5626	NC_011988	TGA	2	6	297874	297879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106370
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5628	NC_011988	TGA	2	6	297920	297925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106370
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5645	NC_011988	CG	3	6	298590	298595	0 %	0 %	50 %	50 %	222106370
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5650	NC_011988	ACC	2	6	298904	298909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106370
5651	NC_011988	TTGGC	2	10	299012	299021	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5652	NC_011988	CTGG	2	8	299107	299114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5653	NC_011988	A	7	7	299169	299175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_011988	GCG	2	6	299345	299350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5660	NC_011988	GCG	2	6	299643	299648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106371
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5694	NC_011988	ACC	2	6	301426	301431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5695	NC_011988	A	6	6	301434	301439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5697	NC_011988	CG	3	6	301565	301570	0 %	0 %	50 %	50 %	222106373
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5739	NC_011988	C	6	6	303967	303972	0 %	0 %	0 %	100 %	222106374
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5743	NC_011988	CGG	2	6	304055	304060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106374
5744	NC_011988	CTG	2	6	304155	304160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106374
5745	NC_011988	TCT	2	6	304205	304210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106374
5746	NC_011988	TCG	2	6	304219	304224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106374
5747	NC_011988	CCCG	2	8	304306	304313	0 %	0 %	25 %	75 %	222106375
5748	NC_011988	CG	3	6	304312	304317	0 %	0 %	50 %	50 %	222106375
5749	NC_011988	TGG	2	6	304328	304333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106375
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5751	NC_011988	TGA	2	6	304389	304394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106375
5752	NC_011988	TG	3	6	304415	304420	0 %	50 %	50 %	0 %	222106375
5753	NC_011988	CT	3	6	304429	304434	0 %	50 %	0 %	50 %	222106375
5754	NC_011988	GTT	2	6	304450	304455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106375
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5756	NC_011988	GCC	2	6	304480	304485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106375
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5760	NC_011988	CGT	2	6	304615	304620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106375
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5762	NC_011988	ATTG	2	8	304648	304655	25 %	50 %	25 %	0 %	222106375
5763	NC_011988	TCG	2	6	304674	304679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106375
5764	NC_011988	CTG	3	9	304709	304717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106375
5765	NC_011988	GCC	2	6	304724	304729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106375
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5771	NC_011988	CGGT	2	8	304908	304915	0 %	25 %	50 %	25 %	222106375
5772	NC_011988	ATC	2	6	304919	304924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106375
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5775	NC_011988	AGCT	2	8	305170	305177	25 %	25 %	25 %	25 %	222106375
5776	NC_011988	T	7	7	305181	305187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5777	NC_011988	CTT	2	6	305264	305269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5778	NC_011988	T	6	6	305268	305273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5779	NC_011988	TAAA	2	8	305288	305295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5780	NC_011988	CGG	2	6	305381	305386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106376
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5785	NC_011988	ATGCC	2	10	305679	305688	20 %	20 %	20 %	40 %	222106376
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5813	NC_011988	GTC	2	6	307120	307125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106377
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5816	NC_011988	GCC	2	6	307342	307347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106378
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5824	NC_011988	GAG	2	6	307804	307809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106378
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5841	NC_011988	TGA	2	6	308682	308687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106379
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5850	NC_011988	TGA	2	6	308985	308990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106379
5851	NC_011988	CGG	2	6	308992	308997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106379
5852	NC_011988	GCTG	3	12	309086	309097	0 %	25 %	50 %	25 %	222106379
5853	NC_011988	CTG	2	6	309143	309148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106379
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5856	NC_011988	TGC	3	9	309231	309239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106379
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5858	NC_011988	CAAA	2	8	309343	309350	75 %	0 %	0 %	25 %	222106379
5859	NC_011988	GACA	2	8	309372	309379	50 %	0 %	25 %	25 %	222106379
5860	NC_011988	AGG	3	9	309452	309460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106380
5861	NC_011988	GGA	2	6	309492	309497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106380
5862	NC_011988	CGA	2	6	309513	309518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106380
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5868	NC_011988	GGCCAT	2	12	309811	309822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222106380
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5977	NC_011988	GC	4	8	315518	315525	0 %	0 %	50 %	50 %	222106385
5978	NC_011988	CGG	2	6	315543	315548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106385
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5984	NC_011988	C	6	6	315769	315774	0 %	0 %	0 %	100 %	222106385
5985	NC_011988	CGG	2	6	315807	315812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5986	NC_011988	CACGA	2	10	315854	315863	40 %	0 %	20 %	40 %	222106386
5987	NC_011988	CCG	2	6	315919	315924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106386
5988	NC_011988	AGC	2	6	315981	315986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106386
5989	NC_011988	GCC	2	6	315990	315995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106386
5990	NC_011988	TCCC	2	8	316083	316090	0 %	25 %	0 %	75 %	222106386
5991	NC_011988	TGG	2	6	316098	316103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106386
5992	NC_011988	TGG	3	9	316116	316124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106386
5993	NC_011988	CGC	2	6	316126	316131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106386
5994	NC_011988	GCG	2	6	316233	316238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106386
5995	NC_011988	CCA	2	6	316253	316258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106386
5996	NC_011988	GCAG	2	8	316294	316301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5997	NC_011988	ACC	2	6	316319	316324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5998	NC_011988	TCA	2	6	316327	316332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5999	NC_011988	GAT	2	6	316514	316519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106387
6000	NC_011988	ATC	2	6	316544	316549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106387

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